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Detail for ZS11_C09G27020.t1

Genome:
ZS11: ZS11_C09G27020.t1
ZS11_v0: BnaC09T0225900ZS
WE: WE_C04G35250.t1
WE_v0: BnaC04T0291100WE
Darmor: C09p26870.1_BnaDAR
BH: BnaC09T080600BH
Quinta: BnaC04T0275600QU
ZS2: BnaC09T221200ZS2
SW: BnaC09T214500SW
Express61: C09p021520.1_BnaEXP
Xiaoyun: BnaC09G0231400XY
P202: BnaC09G038420P202.1
BL: BnaC09T080600BH
TA: BnaC05T276500TA
Da-Ae: rna-gnl|WGS:JAGKQM|BnaA01g16770D
RB: Bnascaffold0005T001000RB
No2127: BnaC09T0187200NO
P130: BnaC09G024160P130.1
Length: 114
KOG ID: KOG3135
KOG E-value: 8.230000e-27
KOG Score: 99.8
KOG Annotation: General function prediction only
Biological Process: -
Cellular Component: -
Molecular Function: -
KEGG Ortholog: K03809 wrbA; NAD(P)H dehydrogenase (quinone) [EC:1.6.5.2]
NR Protein: CDY29120.1
NR E-value: 5.300000e-22
NR Score: 109.0
NR Annotation: CDY29120.1 BnaC09g18460D [Brassica napus]
SwissProt Protein: Q6NQE2|FQRL1_ARATH
SwissProt E-value: 2.500000e-26
SwissProt Score: 100.0
SwissProt Annotation: Probable NAD(P)H dehydrogenase (quinone) FQR1-like 1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At4g27270 PE=1 SV=1
CDS Sequence (349 bp)
ATGAGTGCACCGCCAAAGAGTGATGCTCCTCTTATCACCTCCAACGACCTTGCCGAGGCTGATGCGTTTG
TCTTTGGCTTCCCAACAAGGTTCAGTATGATGGCTGCTCAATTCAAGGCATTCTTAGGTGCAACTGGTGG
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GGTAATCCTCTTCCTTCTGTGGACATTCTCTCATCCACCAACGCCATTGTCTGGTTGCTCATCACAGCCG
TTAAAGCTGTAGTCGCTGCCGCGGAAACTCCAACTCCCATGGCTTTGGGTCCATTGACAATCTAA
Upstream Sequence
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TCTTTGGCTTCCCAACAAGGTTCAGTATGATGGCTGCTCAATTCAAGGCATTCTTAGGTGCAACTGGTGG
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Downstream Sequence
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TTTATTTTAAAGCTTGGAGATGAAGCTCACATATTTATTGTTGTCGTGACCTTTTAAAAT
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AGTTTTTTGTTGTTACCTTATATAAAAATCTTGCCAAAAAAATAAACACTTATACAAAGA
AATTATAAATGTCATCATCA
Pro Sequence
MSAPPKSDAPLITSNDLAEADAFVFGFPTRFSMMAAQFKAFLGATGGLRR
TQQLADGEGEAKQRLLLSPNGNPLPSVDILSSTNAIVWLLITAVKAVVAA
AETPTPMALGPLTI
mRNA Sequence
ATGAGTGCACCGCCAAAGAGTGATGCTCCTCTTATCACCTCCAACGACCTTGCCGAGGCTGATGCGTTTG
TCTTTGGCTTCCCAACAAGGTTCAGTATGATGGCTGCTCAATTCAAGGCATTCTTAGGTGCAACTGGTGG
CCTCAGGAGGACTCAACAACTTGCTGATGGTGAAGGAGAAGCTAAACAGAGGTTGTTGCTCAGCCCAAAT
GGTAATCCTCTTCCTTCTGTGGACATTCTCTCATCCACCAACGCCATTGTCTGGTTGCTCATCACAGCCG
TTAAAGCTGTAGTCGCTGCCGCGGAAACTCCAACTCCCATGGCTTTGGGTCCATTGACAATCTAA