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Detail for ZS11_C09G52020.t1

Genome:
ZS11: ZS11_C09G52020.t1
ZS11_v0: BnaC09T0423000ZS
WE: WE_C09G54050.t1
WE_v0: BnaC09T0397300WE
Darmor: C09p51080.1_BnaDAR
BH: BnaA10T151100BH
Quinta: BnaC09T0389400QU
ZS2: BnaC09T408200ZS2
SW: BnaA10T155100SW
Express61: C09p032460.1_BnaEXP
Xiaoyun: BnaC09G0438800XY
P202: BnaA10G011500P202.1
BL: BnaA10T151100BH
TA: BnaA10T141900TA
Da-Ae: rna-gnl|WGS:JAGKQM|BnaA01g31580D
RB: BnaA10T149000RB
No2127: BnaC09T0363900NO
P130: BnaA05G006880P130.1
Length: 565
KOG ID: KOG1263
KOG E-value: Not available
KOG Score: 973.0
KOG Annotation: Secondary metabolites biosynthesis, transport and catabolism
Biological Process: GO:0046274(lignin catabolic process)
Cellular Component: GO:0048046(apoplast)
Molecular Function: GO:0005507(copper ion binding),GO:0016491(oxidoreductase activity),GO:0052716(hydroquinone:oxygen oxidoreductase activity)
KEGG Ortholog: K05909 E1.10.3.2; laccase [EC:1.10.3.2]
NR Protein: XP_013701006.1
NR E-value: Not available
NR Score: 1167.9
NR Annotation: XP_013701006.1 laccase-16 [Brassica napus]
SwissProt Protein: Q1PDH6|LAC16_ARATH
SwissProt E-value: Not available
SwissProt Score: 1054.0
SwissProt Annotation: Laccase-16 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=LAC16 PE=2 SV=2
CDS Sequence (1722 bp)
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Upstream Sequence
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Downstream Sequence
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TGGCTTCGGGCCACGGTGCATGGGGCCATTGTCATCTTGCCTAAGCTTGGTGTCCCATAC
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AAAGCGTTAATGCGGCGACGATGACAGGTACAAAGCTTTACCGGCTTCCTTACAACGCGA
CGGTGCAAATCATTCTACAAAATACGGCGATGATCTTGTCGGAGAACCATCCGTTTCATC
TTCACGGGTTTAACTTCTTT
Pro Sequence
MEIPRRFSVCILTLFVIFLLSPTTVHSIIRHYKFNVVMTNTTKLCSSKPI
VTVNGQFPGPTIVAREDDTVLIKVVNHVKYNVSIHWHGVRQLRTGWADGP
AYITQCPIQPRQNYFYNFTLTGQRGTLWWHAHILWLRATVHGAIVILPKL
GVPYPFPKPYKEKTIVLGEWWKSDVEQLINEATKHGTAPNASDAHTINGH
SGPISNCPSQSGYGLPVRPGKTYMLRIINAALNEELFFKIAGHKLTVVEV
DAVYTKPYKTDTVLIAPGQTTNVLLTANANTGSKYMVAATTFMDAPISFD
NVTATATLHYIGHTVSSSKKTVLASLPQPNATLVSSKFIKSLRSLNSREY
PAKVPTTVDHSLFFTVGLGANPCPSCNNGIRLVAGINNVTFTMPETALLQ
AHYFNISHVFTDDFPAKPSNPYNYTAPVDQSVNAATMTGTKLYRLPYNAT
VQIILQNTAMILSENHPFHLHGFNFFEVGRGLGNFNPEKDPKRFNLVDPV
ERNTVGVPAGGWTAIRFIADNPGVWFMHCHLEIHTTWGLKMAFVVDNGHG
PDQSLLPPPADLPKC
mRNA Sequence
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GATCTTCCCAAATGTTAG