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Detail for ZS11_C09G55620.t1

Genome:
ZS11: ZS11_C09G55620.t1
ZS11_v0: BnaA10T0168600ZS
WE: WE_C09G57960.t1
WE_v0: BnaC09T0426900WE
Darmor: C09p54850.1_BnaDAR
BH: BnaA10T176000BH
Quinta: BnaC09T0419900QU
ZS2: BnaA10T167200ZS2
SW: BnaA10T180600SW
Express61: C09p035350.1_BnaEXP
Xiaoyun: BnaC09G0470300XY
P202: BnaC09G098650P202.1
BL: BnaA10T176000BH
TA: BnaA10T167100TA
Da-Ae: Not available
RB: BnaA10T173300RB
No2127: BnaC09T0393100NO
P130: BnaA10G018600P130.4
Length: 217
KOG ID: -
KOG E-value: Not available
KOG Score: Not available
KOG Annotation: -
Biological Process: -
Cellular Component: GO:0009535(chloroplast thylakoid membrane),GO:0010598(NAD(P)H dehydrogenase complex (plastoquinone))
Molecular Function: -
KEGG Ortholog: K23052 ndhU; NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit U, chloroplastic [EC:7.1.1.-]
NR Protein: XP_013717598.1
NR E-value: 4.400000e-118
NR Score: 429.1
NR Annotation: XP_013717598.1 NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit U, chloroplastic [Brassica napus]
SwissProt Protein: Q84VQ4|NDHU_ARATH
SwissProt E-value: 5.420000e-126
SwissProt Score: 357.0
SwissProt Annotation: NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit U, chloroplastic OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=ndhU PE=1 SV=1
CDS Sequence (663 bp)
ATGGCTTCCTTATCTCCGATGACTCAACTGTCGTTAGTCCACATTCCCGGCGAATCCATCCCCCACCACG
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Upstream Sequence
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Downstream Sequence
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Pro Sequence
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TSTEGETDGGSSTAVDEAPKETPSLISALNVERALRGLPITDVDHYGRLG
LLRNCSYDQVRIGYQDRVKELMEQGLEEEQLKNKMELVKDSYTILSSVEE
RRMYDWSLARSEKAERYIWPFEVDIMEPSREEPPPQEPEDVGPTRILGYF
IGAWLVLGVALSVALNR
mRNA Sequence
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TTATCTCCGATGACTCAACTGTCGTTAGTCCACATTCCCGGCGAATCCATCCCCCACCACGTACCAAGCA
CGTGCTCTTTCCCGCGGAAGCTAACAATCACAAAACGGATTATCTGTTCGCCGGCGAGGAGTTCCGGTGA
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TCTTTAATCTCCGCTCTCAACGTCGAACGTGCTCTACGTGGCCTTCCCATTACAGATGTGGATCACTACG
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TATTAGTAGTCGTTTATATACCCAAGTGTATTATTAGTTATCTGACGAATGTTAAAGCTACGTAATTGCA
ATAACGTTATGTGCGTATTATTGCGGATCTTCGAATAGTCGTGCTTACAGTGCAATCATATGTTCATTGT
TTTTAATCCAT