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Detail for ZS11_C09G71860.t1

Genome:
ZS11: ZS11_C09G71860.t1
ZS11_v0: BnaC09T0592600ZS
WE: WE_C09G74470.t1
WE_v0: BnaC09T0564500WE
Darmor: C09p71310.1_BnaDAR
BH: BnaC09T480800BH
Quinta: BnaC09T0554000QU
ZS2: BnaC09T580700ZS2
SW: BnaA10T324500SW
Express61: A10p026740.1_BnaEXP
Xiaoyun: BnaA10G0282500XY
P202: BnaC09G113070P202.1
BL: BnaC09T480800BH
TA: BnaA10T279400TA
Da-Ae: rna-gnl|WGS:JAGKQM|BnaA01g31580D
RB: BnaC09T473900RB
No2127: BnaC09T0529200NO
P130: BnaC09G071580P130.1
Length: 565
KOG ID: KOG1263
KOG E-value: Not available
KOG Score: 1095.0
KOG Annotation: Secondary metabolites biosynthesis, transport and catabolism
Biological Process: GO:0046274(lignin catabolic process)
Cellular Component: GO:0048046(apoplast)
Molecular Function: GO:0005507(copper ion binding),GO:0016491(oxidoreductase activity),GO:0052716(hydroquinone:oxygen oxidoreductase activity)
KEGG Ortholog: K05909 E1.10.3.2; laccase [EC:1.10.3.2]
NR Protein: XP_013741478.1
NR E-value: Not available
NR Score: 1178.7
NR Annotation: XP_013741478.1 laccase-12 [Brassica napus]
SwissProt Protein: Q9FLB5|LAC12_ARATH
SwissProt E-value: Not available
SwissProt Score: 1095.0
SwissProt Annotation: Laccase-12 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=LAC12 PE=2 SV=1
CDS Sequence (1722 bp)
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Upstream Sequence
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TTGAACTAAGGGCT
Downstream Sequence
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TACTCGGTATATACTGTGCCAAACCAAAACAATTCTCTCCACTAGCTACATATTTTTTTT
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AAAACTATATAGTATATGATATCTTAGTAAATTATTTGAAAATGTTATGATACATTACAC
TTTGCAACTTGCAGAGACTGTTGTAGTACCAGTAAAATCAGGTGAAACAAGTCTACTACG
AGTGATCAACGCAGCTTTAAACCAACCACTATTTTTCACGGTGGCTAACCACAAGCTCAC
CGTGGTCGGAGCCGACGCATCCTATCTCAAACCATTCACCACAAAGTTCCTCATGTTAGG
TCCGGGTCAAACCACCGACGTACTTCTAACCGCAGACCAACCGCCCAAACGCTATTACAT
AGCAGCCAGAGCATACCAAAGCGCTCAAAACGCACCGTTTGATAACACTACAACAACAGC
CATTCTCCATTACAGAAACACGTCCAAAACTTCTCCACCAATCGCAGCCTCTTTGCCTGC
CTTCAACGACACGAACACCGTGACGTCATTCTCCAGAAAATTCAAATCTCTTCGAAACGT
CGTCGTGCCGAAAACAATTGACGAGAACTTGTTCTTCACCATCGGTTTAGGTCTCGATAA
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CTCGATGAACAACGTCTCGTTTGTTCTGCCGTCGAACTTCTCGCTCTTGCAAGCGCATTC
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TTATACCGGAAATAACATAAGCAGGGGTCTGTTTCAACCGGTTAAGGGTACTAAGCTGTA
TAAGCTCAAGTATGGAACTAGAGTTCAGATTGTTTTACAGGACACGAACATTGTTACGTC
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TAACTTTAATCCCAAGAAAGACAATTCTAAGTTTAACCTCGTTGATCCTCCGCTTAGAAA
CACTGTGGCTGTTCCTGTTAACGGATGGGCTGTTATCAGATTCGTGGCTGATAATCCAGG
TATGTTACAAAAGTTCTCGA
Pro Sequence
MMALPTFSCLFFFCSLLSASSIIAKVQHHNFVIQETPVKRLCKTRNAITV
NGMFPGPTLEVNDGDTLEVKVLNRARYNITIHWHGVRQMRTGWADGPEFV
TQCPIRPGKSYTYRFTIQGQEGTLWWHAHSSWLRATVYGALIIHPAPGSS
FPFPKPDRQTALVLGEWWNANPVDVINQATRTGAAPNISDAYTINGQPGD
LYNCSNKETVVVPVKSGETSLLRVINAALNQPLFFTVANHKLTVVGADAS
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TTAILHYRNTSKTSPPIAASLPAFNDTNTVTSFSRKFKSLRNVVVPKTID
ENLFFTIGLGLDNCPKNFPKNRCQGLNGTRFTASMNNVSFVLPSNFSLLQ
AHSNGIPGVFTTDFPAKPPVKFDYTGNNISRGLFQPVKGTKLYKLKYGTR
VQIVLQDTNIVTSENHPIHLHGYDFYIVAEGFGNFNPKKDNSKFNLVDPP
LRNTVAVPVNGWAVIRFVADNPGVWLMHCHLDVHIKWGLGMAFLVENGVG
ELETLEAAPHDLPVC
mRNA Sequence
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GCTCAAAGTGTAAAACACACACGATGATGGCCCTTCCCACGTTCTCTTGCTTGTTCTTCTTTTGTTCCCT
TCTCTCCGCTTCATCGATCATCGCTAAAGTTCAACACCATAACTTCGTTATACAAGAGACACCAGTGAAG
AGGCTGTGCAAGACCCGTAATGCTATCACCGTTAACGGAATGTTTCCTGGACCCACACTCGAAGTCAATG
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GAGGCAGATGAGAACTGGATGGGCTGATGGGCCTGAATTCGTGACCCAATGCCCAATCCGACCCGGAAAG
AGCTACACATACCGTTTCACTATCCAAGGACAAGAAGGAACACTATGGTGGCACGCGCATAGCTCATGGC
TCCGAGCCACCGTCTACGGTGCACTCATCATCCACCCTGCCCCTGGTTCCTCTTTCCCCTTCCCTAAACC
GGACCGTCAAACCGCTCTCGTACTCGGGGAATGGTGGAATGCAAATCCGGTTGATGTAATTAACCAAGCG
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ATTGCTCAAACAAAGAGACTGTTGTAGTACCAGTAAAATCAGGTGAAACAAGTCTACTACGAGTGATCAA
CGCAGCTTTAAACCAACCACTATTTTTCACGGTGGCTAACCACAAGCTCACCGTGGTCGGAGCCGACGCA
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TGATAACACTACAACAACAGCCATTCTCCATTACAGAAACACGTCCAAAACTTCTCCACCAATCGCAGCC
TCTTTGCCTGCCTTCAACGACACGAACACCGTGACGTCATTCTCCAGAAAATTCAAATCTCTTCGAAACG
TCGTCGTGCCGAAAACAATTGACGAGAACTTGTTCTTCACCATCGGTTTAGGTCTCGATAACTGTCCCAA
GAACTTTCCCAAAAACCGGTGCCAGGGATTAAACGGAACCCGGTTTACTGCCTCGATGAACAACGTCTCG
TTTGTTCTGCCGTCGAACTTCTCGCTCTTGCAAGCGCATTCCAACGGTATTCCAGGCGTTTTCACGACGG
ATTTTCCAGCTAAACCGCCGGTTAAATTCGATTATACCGGAAATAACATAAGCAGGGGTCTGTTTCAACC
GGTTAAGGGTACTAAGCTGTATAAGCTCAAGTATGGAACTAGAGTTCAGATTGTTTTACAGGACACGAAC
ATTGTTACGTCGGAGAATCATCCGATTCATCTTCACGGTTACGATTTCTACATTGTCGCTGAAGGGTTTG
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TGTTCCTGTTAACGGATGGGCTGTTATCAGATTCGTGGCTGATAATCCAGGGGTTTGGTTGATGCATTGT
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AGACTCTTGAAGCTGCTCCTCATGATCTACCTGTTTGCTAGTATCACGGTCGAAATCATCACAGAGATTA
TAGATCCAACAAAGGAGACGCTATTTGAATTTTTGGTGTTGTATTGGATTAAAATGTAATTGTTTTATTT
TTGAACTAAGGGCT