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Detail for scaffold0123G00030.t1

Genome:
ZS11: scaffold0123G00030.t1
ZS11_v0: Bnascaffold0123T0000300ZS
WE: WE_C02G48720.t1
WE_v0: Bnascaffold3194T0000500WE
Darmor: A04p09550.1_BnaDAR
BH: Not available
Quinta: BnaC01T0217600QU
ZS2: Not available
SW: Not available
Express61: C09p019850.1_BnaEXP
Xiaoyun: BnaC01G0350300XY
P202: BnaA03G043620P202.1
BL: Not available
TA: Not available
Da-Ae: Not available
RB: Not available
No2127: BnaC04T0212900NO
P130: BnaC06G027000P130.1
Length: 175
KOG ID: KOG4668
KOG E-value: 2.560000e-89
KOG Score: 271.0
KOG Annotation: Energy production and conversion
Biological Process: -
Cellular Component: -
Molecular Function: -
KEGG Ortholog: -
NR Protein: CDY45553.1
NR E-value: 2.000000e-81
NR Score: 307.0
NR Annotation: CDY45553.1 BnaCnng13120D [Brassica napus]
SwissProt Protein: O05000|NU2M_ARATH
SwissProt E-value: 9.070000e-72
SwissProt Score: 227.0
SwissProt Annotation: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 2 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=ND2 PE=2 SV=2
CDS Sequence (535 bp)
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GCACGTGTGGTTCTGGCCGGGCTTTCCTGAGGTATCTAATAACCTTGCTTCTGCTCGCCGCTGGCGCACC
TCTCCTAACTATTGCCCATTTATTCTGGAATAATCTTTTTAGGAGGGACAATTTTACATATTTCTGCCAA
ATCTTTCTATTATTAAGTACGGCTGGTACCATTTCGATGTGTTTCGATTCTTCCGACCAAGAGAGGTTTG
ATGCTTTTGAATTCATTGTATTAATTCCACTTCCTACTTGCGGTATGCTCTTTATGATCTCGGCTCATGA
TTTAATTGCCATGTATTTAGCTATTGAGCCTCAAAGTTTATGTTTTTATGTAATCGCAGCATCAAAAAGA
AAGTCTGAATTTTCCACGGAAGCCGGCTTGAAATATTTGATCTTAGGTGCATTTTCCTCTGGAATATTAT
TGTTTGGGTACGACCGGACAACTACCGATATCAATTAA
Upstream Sequence
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GCACGTGTGGTTCTGGCCGGGCTTTCCTGAGGTATCTAATAACCTTGCTTCTGCTCGCCGCTGGCGCACC
TCTCCTAACTATTGCCCATTTATTCTGGAATAATCTTTTTAGGAGGGACAATTTTACATATTTCTGCCAA
ATCTTTCTATTATTAAGTACGGCTGGTACCATTTCGATGTGTTTCGATTCTTCCGACCAAGAGAGGTTTG
ATGCTTTTGAATTCATTGTATTAATTCCACTTCCTACTTGCGGTATGCTCTTTATGATCTCGGCTCATGA
TTTAATTGCCATGTATTTAGCTATTGAGCCTCAAAGTTTATGTTTTTATGTAATCGCAGCATCAAAAAGA
AAGTCTGAATTTTCCACGGAAGCCGGCTTGAAATATTTGATCTTAGGTGCATTTTCCTCTGGAATATTAT
TGTTTGGGTACGACCGGACAACTACCGATATCAATTAA
Downstream Sequence
GTTTCCCCAGAGATCTTTATCATTAATGCAACCTCCATTTTGCTCATTCATGGAGTTGTA
TTTAGTACCTCTAAGAAATATGATTATCCGCCGTTAGCCAGTAATGTGGGTTGGCTTGGA
TTACTTAGTGTTGCGCGCCTAGGAGGGCAGCGCGCTTGGGGATGCAGAGGAGCTATTATC
GCCCAGCCCCTACCCTAACCTAATGCGGCACCGGATTCGGACCGCAGGGAACCGTAGCAT
GGGGGGGCGTCTAATCCTTTTGCCGCCGCAAGGCTGGCTAATCGTACGCAGCAGGCTCGA
AGACCCCTGGTTCTGGAAGGCACATGAGTCCGAACGCTATGTTGAATGTGCGACCGACAC
TACGTAGGTACCAGTGCAGGTGAGGCGTCGGTCGGTCCTAGAAACGGCGGCAACGGCGCG
AGGAGTTAACGACCGGACGTGCTGCAACCTAGGGATCACCAGGCAGCTCTTTCGCTCTAT
AGGGATCGGGGGGGCATAGCACAATTCCTCTTGGAGGGGGGTTGGTTTGCCCGGGTGACT
GATCCTGCCATAATGTACTCCTACCTATAGCACCGGCAACCGAAGTCAAGCATACATAGG
ACGATCTTCATGCGTGAATAGCCGGGAGGAAATAAAGGGCGGTAGATGATAATGAAAAAG
GGCGCCGCGTCTGTACGGGCGGGCGGAATGGATGAGCAAAAGGTGCCATGGGGTGAGGAA
TATCCCGAGTCTCATGTAAGACAACTAAATGCACCCCGCCGAGGTGCTGCCGAGGAACTG
GGAGACCTTCTCGAGCACAGGATAGGCAATTGAAAGACAAAGCTAGCCTATTCGTTATGG
GGAATCAATGCTCCGGGCCGAATAAAGCTTACCTCCGGCACCTGGCTTTCCCCGGCGCAT
ATTAGCTTAGCTGTGCTTAATAGGTCGGTTTGTTTGGCTTCCTCTCTTAGCCCATTCCTA
ACCAGTGGAGAAAAGGTTCGCTCATGCTGGAGGGAGCATCCCCACTTAGTGATCGGTCTG
CTAGTTCACGCAAATCCGAAGAAGTTATCACGGACGAGCCACATGCAGGGAAACTTGCAC
GTGTGGTTCTGGCCGGGCTTTCCTGAGGTATCTAATAACCTTGCTTCTGCTCGCCGCTGG
CGCACCTCTCCTAACTATTGCCCATTTATTCTGGAATAATCTTTTTAGGAGGGACAATTT
TACATATTTCTGCCAAATCTTTCTATTATTAAGTACGGCTGGTACCATTTCGATGTGTTT
CGATTCTTCCGACCAAGAGAGGTTTGATGCTTTTGAATTCATTGTATTAATTCCACTTCC
TACTTGCGGTATGCTCTTTATGATCTCGGCTCATGATTTAATTGCCATGTATTTAGCTAT
TGAGCCTCAAAGTTTATGTTTTTATGTAATCGCAGCATCAAAAAGAAAGTCTGAATTTTC
CACGGAAGCCGGCTTGAAATATTTGATCTTAGGTGCATTTTCCTCTGGAATATTATTGTT
TGGGTACGACCGGACAACTACCGATATCAATTAATATCTTTTTTTAGAATGTTGTTGTTA
AATAGATAAATATCTATCTATATTGTAAACTATCGGATCGGGTATTACTTAGATGTGAAA
CTTTAAGACCTCATTAGTTGTGATATTGATCTTACGGGGGGGGAACGAAATCAAAGAATA
TATAGACTTGTAAAGACCCTCTATGTAGTTGTCTATCTAAAGGCGATCGATCTACATCTT
TCTCCATAGCCCTTGGGCTGTGTCTCGATCTCCTACGTGCGAAATCAGAGGGACCTGTTT
CTATGGAGATTCCCTTGGTCTAATTCCACGCCTTATGACGAAAGGAGAGTCGGCGTGGCA
TCAAGTGAAGATTTAGGGAAGTATAGAAAAATTCCCTTCTGGGGTATTCCGAAGGTGTAA
CCTAGGCAACGAAAAGGGGCCCGATACTTCAACTAGAGGAGCGACCAGTTGGTTCACCAA
ACCCCGACCCAGCGTCACAC
Pro Sequence
MKAEFVRILPHVQSFFSATCRETCTCGSGRAFLRYLITLLLLAAGAPLLT
IAHLFWNNLFRRDNFTYFCQIFLLLSTAGTISMCFDSSDQERFDAFEFIV
LIPLPTCGMLFMISAHDLIAMYLAIEPQSLCFYVIAASKRKSEFSTEAGL
KYLILGAFSSGILLFGYDRTTTDIN
mRNA Sequence
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GCACGTGTGGTTCTGGCCGGGCTTTCCTGAGGTATCTAATAACCTTGCTTCTGCTCGCCGCTGGCGCACC
TCTCCTAACTATTGCCCATTTATTCTGGAATAATCTTTTTAGGAGGGACAATTTTACATATTTCTGCCAA
ATCTTTCTATTATTAAGTACGGCTGGTACCATTTCGATGTGTTTCGATTCTTCCGACCAAGAGAGGTTTG
ATGCTTTTGAATTCATTGTATTAATTCCACTTCCTACTTGCGGTATGCTCTTTATGATCTCGGCTCATGA
TTTAATTGCCATGTATTTAGCTATTGAGCCTCAAAGTTTATGTTTTTATGTAATCGCAGCATCAAAAAGA
AAGTCTGAATTTTCCACGGAAGCCGGCTTGAAATATTTGATCTTAGGTGCATTTTCCTCTGGAATATTAT
TGTTTGGGTACGACCGGACAACTACCGATATCAATTAA